HISTÓRICO E FUNDAÇÃO
Em 28 de janeiro de 1988, por meio do Decreto nº 28.196, foi estabelecida a E.E.P.G. Vila Dr. João Batista, situada na Praça João Cabete, no bairro Jardim Paraíso, em Cruzeiro. Em 1990, passou a ser chamada de E.E.P.G. Padre Francisco de Assis Carvalho, conforme o Decreto Oficial nº 6.651. Mais tarde, em 1999, por determinação legal, sua denominação foi alterada para E.E. Padre Francisco de Assis Carvalho, conforme parecer CEE 67/98, processo CEE 152/98.
Em 2010, a escola, antes uma Escola Estadual da Diretoria de Ensino de Guaratinguetá, passou pela municipalização do ensino em Cruzeiro, tornando-se a E.M. Padre Francisco de Assis Carvalho.
Atualmente, a escola oferece ensino do 6º ao 9º ano do Ensino Fundamental.